木箱內，由美國公使館運送至美國海軍陸戰隊總部，指令美軍上校阿舒爾斯特負責押運。
阿舒爾斯特上校命令士兵將兩隻木箱改裝到美軍專用標準化箱裡，等待裝船。按照原定計劃，12月11日有一艘“哈里遜總統”號輪船將由上海抵達秦皇島，然後由秦皇島駛往美國。美國海軍陸戰隊軍醫福萊受上校之命，將標準化箱連他個人的行李共24箱由帝京押運至秦皇島霍爾坎伯美軍兵營，福萊將要護送這批化石安全抵達美國。
意想不到的事情發生了。12月7日，珍珠港事件爆發。秦皇島霍爾坎伯兵營被日軍佔領，美國海軍陸戰隊隊員全部成為俘虜。不久，這批俘虜被押送至天津戰俘營。過了十來天，美軍戰俘的行李由秦皇島轉運至天津，福萊醫生的行李大部分還在，其中包括裝有帝京猿人化石的美軍專用標準化箱。
福萊醫生將他的剩餘行李，包括標準化箱在天津就地疏散了：一部分存放在瑞士商人在天津建造的倉庫裡，一部分存放在法租界巴斯德研究所，一部分存放在中國友人家裡。疏散前，福萊醫生沒有開啟過標準化箱子。
戰爭結束以後，裝有帝京猿人化石的標準化箱子下落不明。中國的無價之寶經美國海軍陸戰隊之手，由帝京至秦皇島，由秦皇島至天津，最後在天津失蹤。
帝京猿人化石到哪裡去了？一種說法是，標準化箱在秦皇島被裝上了“哈里遜總統”號輪船，但該船不幸在赴美途中沉沒。帝京猿人化石沉入了海底。有人說，輪船沒有沉沒，而是中途為日軍所截獲，化石落入日軍之手，後來下落不明。
另一種說法是，帝京猿人化石根本就未出北平城，它被埋在美國駐京公使館的後院裡。一個在美國海軍陸戰隊總部門口擔任過守衛之職的衛兵回憶說，珍珠港事件爆發前夕，他看到有兩人將一箱東西偷偷地埋在院子裡，他估計有可能是帝京猿人化石。
聽了這些，楊波微微皺眉，他看向曹元德，“這就是全部了？你既然想要讓我找到遺骨，那就應該是有更為確切的訊息的！”
曹元德笑道：“不要心急，我還沒有說到呢，最近一段時間，我們的特殊部門，在和倭國的的交鋒中，發現了一些未經解密的證據，接過翻譯，發現了周口店猿人遺骨的下落！”
“在哪裡？”楊波有些吃驚。