經過一番準備，在江南一片明媚的光中，劉元於三月初三正式登基，由於周瑜替他們修建的新宮殿尚未完工，便暫時居住在州牧府旁的臨時住所，周瑜特意令人將其修葺一新，增添了很多皇家用品，看起來花團錦簇、金碧輝煌，頗有皇家氣概。
劉元尚是八歲幼童，自小長在鄉間，哪裡見過登基這麼大的場面，手腳無措，一路上由母親範氏攙扶著方完成了一系列的儀式。登基之後，劉元下詔，改元天佑，當年為天佑元年，尊劉協為獻帝。
隨後，便是一長串的百官名單。
此時，周瑜還不想對官製做太多的改動，他覺得時機未到，因此百官體制還是沿襲舊制。除了曹操的親信之外，原先在許都的一些朝官仍舊使用，以便於政令的延續。在朝官中出現了許多的新面孔，自然都是周瑜的親信，為了團結劉備，也讓他安排了一些他的屬下進入了朝政中樞。
封劉備為真定王、任職太尉。
封周瑜為吳侯、任職大將軍，統領天下兵馬。
前朝老臣原太尉楊彪任職司徒，掌管禮儀諸事，負責人民教化。
司空一職，則由劉備推薦的孔融擔任，負責水利工程、城防建築、宮室營建諸事。
三公既定，太常、光祿勛、衛尉、太僕、大鴻臚、宗正、大司農、少府等九卿的任官也隨之確定。這段時間，秣陵已成為天下文人學子心中的熱土，不僅原先許都的各級官員舉家南下，就連袁紹的不少屬下也背離袁紹，投入了周瑜的帳下，比較知名的有陳琳、王修等人。周瑜從中挑選了一些人進入朝廷任職。
九卿分別為太常孫邵、光祿勛陳琳、衛尉董昭、太僕傅燮、大鴻臚淳于嘉、宗正張紘、大司農國淵、少府王修。
尚書臺是朝廷的中樞機關，權力極重，既出詔令，又出政令。朝臣選舉，由尚書臺主管，還擁有糾察、舉劾、典案百官之權，參預國家重大政事的謀議、決策，對朝政有著重大影響。
第五百零九章 冊封百官
如同曹安排自己的心腹荀彧為尚書令，以便自己決斷朝政一樣，周瑜特意指定由賈詡擔任尚書令。由於賈詡需經常為周瑜的軍事行動出謀劃策，又任劉曄為尚書僕射，協助賈詡處理日常事務。尚書臺下暫設尚ì郎二十八人，以尚書左丞張承、右丞張範為。
黃門令負責照顧皇室成員的生活起居，傳達天子的旨意，也是一個十分重要的職務，為防止宦官勾結作，周瑜特意啟用女官，以小喬的姐姐喬瑩為黃門令，從女兵營中選取數十名長相俊秀的女兵，入宮照顧天子及皇太后等人。
文臣宣讀完畢，便是武將系列了。
袁紹謀逆，部下弒殺先帝，所任大將軍一職自是被剝奪，由周瑜執掌，成為名義上的隊總指揮。董承傳遞衣帶血詔、驅除曹有功，被封為西陽侯，任職驃騎將軍，僅次於周瑜的大將軍一職。
為安撫劉備，天子詔令封關羽為壽亭侯、車騎將軍，兼任冀州刺史，張飛為光亭侯、衛將軍，兼任幽州刺史。其意十分明顯，待擊敗袁紹、打下冀青幽並四州後，冀州和幽州的地盤就是劉備兄弟的了。劉備靡下週倉、廖化、杜遠、裴元紹等皆被封為將軍。
甘寧被封為左將軍，兼任水軍大都督，是江東水軍各部的最高統帥。o臧霸被封為右將軍，兼任騎兵大都督，是江東騎兵各部的最高統帥。
高順被封為前將軍，兼任步兵大都督，是江東步軍各部的最高統帥。
王越被封為後將軍，兼任弓兵大都督，是江東弓兵、輜重兵各部的最高統帥，軍種包括弓兵、弩兵、投石兵、攻城兵等。
周瑜帳下的多員虎將全部得到了封賞，如張遼任鎮東將軍、徐晃任鎮北將軍、趙雲任鎮西將軍、太史慈任鎮南將軍、黃忠任北中郎將、魏