鬥爭
在門達諾發生的戰爭導致了數千名士兵和平民的死亡,數以萬計的人無家可歸菲律賓穆斯林指控政府進行種族屠殺,這引起了國際穆斯林社會的同情和關注而國際輿論的關心又迫使菲律賓政府與摩洛民族解放陣線談判講和
摩洛內部大分裂
1976年12月,在利比亞政府的幹預和穆斯林會議組織的支援下,菲律賓政府和摩洛民族解放陣線在利比亞的黎波里進行協商著手解決雙方的矛盾衝突這次談判最終達成了的黎波里協議,雙方同樣停火,政府保證大部分是由穆斯林居住的南方13省實現自治
然而,馬科斯總統卻極力按自己的意願利用停火1977年春,他依照政府的想法建立了一種自治形式而同樣是在這個時候,密蘇瓦里及其支持者一直在和陣線內部的邦薩摩洛解放組織及其支持者進行權力鬥爭邦薩摩洛解放組織是這場遊戲鬥爭的新加人者,其領導人主要是一些老派的穆斯林貴族,其宗旨依然是實現穆斯林獨立不幸的是這些穆斯林領導人認為密蘇瓦里所處的語言人種及社會地位與他們完全不同所以邦薩摩洛解放組織想藉助摩洛民族解放陣線中央委員會副主席薩拉邁&iddot;雜湊姆把密蘇瓦里從摩洛民族解放陣線中清除出去
這場陰謀最終失敗,薩拉邁被清除出該組織由於薩拉邁號召人們從密蘇瓦里那裡獨立出來,所以這場陰謀之後產生了三個派別:摩洛民族解放陣線一密蘇瓦里派,邦薩摩洛解放組織和摩洛民族解放陣線一密蘇瓦里派（該派後來就成為摩洛伊斯蘭解放陣線）
1979年前伊朗政權倒臺,阿亞圖拉&iddot;霍梅尼成為新政權的領袖,霍梅尼強力支援密蘇瓦里派,這一支援導致了菲律賓對伊朗石油的禁運
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